Al igual que la Guarida del Dragón, el modo de juego de Space Ace requiere que el jugador mueva el joystick en la dirección correcta o pulse el botón de disparo en el momento justo para evitar los diversos peligros que enfrenta Dexter / as. Space Ace introdujo un par de mejoras en el juego, sobre todo seleccionable Niveles de habilidad y múltiples caminos a través de varias de las escenas. Al comienzo del juego, el jugador podría seleccionar uno de los tres niveles de habilidad; "Cadet", "Captain" o "Space Ace" para fácil, medio y duro respectivamente - sólo eligiendo el nivel de habilidad más difícil podría el jugador ver todas las secuencias en el juego (sólo alrededor de la mitad de las escenas se juega en el ajuste más fácil) . Algunas de las escenas tenían momentos de "elección múltiple" en los que el jugador podía elegir cómo actuar, a veces eligiendo la forma de dar vuelta en un pasillo o eligiendo si reaccionaría o no al mensaje "ENERGIZAR" en la pantalla y transformar de nuevo en As.
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